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- 2ndでは現在テネリクテス門を分けているが、近年の系統解析ではファーミキューテス門に含まれる見解が支配的である[要出典]。 系統樹はAnnotreeとGTDB (release 05-RS95 (17 July 2020))を利用して作成された。 バシラス目/Bacillales ラクトバシラス目/Lactobacillales…16キロバイト (1,935 語) - 2024年3月21日 (木) 09:30
- に属す新綱とされている。未培養のメタン菌であるウェルストラエテ古細菌も綱として編入される場合がある。 一方、全原核生物の分類を分岐距離で再評価したGTDB分類(The Genome Taxonomy Database)では、TACKを再度吸収して6綱(うち未記載綱4つを含む)となっている。 テルモプロテウス綱/Thermoprotei…12キロバイト (1,720 語) - 2024年8月11日 (日) 16:54
- バクテロイデス/クロロビウム系統は比較的細分化が進んでいる系統であり、LPSNは5門、NCBIは分類表内の6門を設置する一方、分岐距離で全原核生物の分類を再評価したGTDB分類はバクテロイデス門(Bacteroidota)にまとめている。 この群全体の形質は乏しいが、鞭毛の喪失と滑走による運動性、細胞膜にスフィンゴ脂質を含むという傾向が広くみられる。…3キロバイト (295 語) - 2021年11月30日 (火) 10:52
- 分子(セルロースまたはキチン)を分解する能力がある。 バージェイ分類、NCBI、LPSN、GTDB(Genome Taxonomy Database)いずれの分類方式でも独立門として認めている。ただし、GTDBではキティニスピリッルム綱はキティニウィブリオ目に統合されている。 Abdul, Rahman…2キロバイト (164 語) - 2024年3月18日 (月) 03:35
- リケッチア目、ホロスポラ目)。他の細菌や古細菌と同様、その分類や系統関係については現在も絶えず改定が続いている。NCBIのデータベースでは現在20の目が設定されている。一方、GTDBでは35の目が設定されている。分子系統解析とアルファプロテオバクテリア綱メンバーのゲノムに特徴的なインデルの分析により、アルファプロテオバクテリア…52キロバイト (5,225 語) - 2024年11月14日 (木) 13:30
- 初考えられていたよりも新しい可能性が高い。CPR細菌はグラム染色では陰性だが、多くのCPR細菌は外膜を欠いており、構造的にグラム陽性菌と共通する。GTDB分類(The Genome Taxonomy Database)は、この系統に対してPatescibacteriaの1つの門しか割り当てていない。…5キロバイト (612 語) - 2022年12月24日 (土) 03:15
- 年に提唱された門である。元々はバクテロイデス門に含まれていた。海洋性や好塩性の細菌を含む。2018年現在、NCBIやLPSNは独立門としているが、GTDBはバクテロイデス門にまとめている。 バルネオラ科は海水又は塩湖、製塩所などの高塩環境から分離され、ソオルティア科の1種はイランバダブソートのトラバ…3キロバイト (368 語) - 2023年3月28日 (火) 18:20
- 環境に豊富に存在する未培養の古細菌系統である。Euryarchaeota SM1系統とも呼ばれる。NCBI分類ではユーリ古細菌門の下に置かれるが、GTDB分類ではユーリ古細菌門は分割されており、独立門として扱われる。 培養はされていないが、"アルティアルカエウム・ハミコネクスム"("Ca. Altiarchaeum…3キロバイト (285 語) - 2018年11月25日 (日) 12:31
- 独立の門として扱っているが、主流ではない。LPSN及びNCBIはクロロフレクサス門に所属する綱として扱っており、バージェイ式分類は独立の門として、GTDBはクロロフレクサス綱に所属する目として扱っている。 2019年現在までに記載されているのは、Thermomicrobium roseum、T.…3キロバイト (317 語) - 2022年7月13日 (水) 10:21
- より正確な分類を目指す動きが活発となっている(例えばGTDB)。その結果、古典的によく知られた細菌の分類が解体されることも珍しくなく、現在も絶えず新しいグループの追加と既存のグループの書き換えが進んでいる(例えばデルタプロテオバクテリア)。GTDBによれば、2021年7月時点で、127の門(Phylum)が記載されている。…154キロバイト (21,138 語) - 2024年7月19日 (金) 04:37
- Nomenclature(LPSN)とアメリカ国立生物工学情報センター(NCBI)により提供されている。 LTP_08_2023提供の16S rRNA遺伝子配列に基づく系統樹 GTDB 08-RS214提供の120個のマーカータンパク質のシングルコピー遺伝子配列に基づく系統樹 ^ a b Garrity GM, Bell JA,…17キロバイト (1,065 語) - 2024年9月30日 (月) 15:16
- 23 February 2021閲覧。 ^ “LTP_12_2021 Release Notes”. 23 February 2021閲覧。 ^ “GTDB release 07-RS207”. Genome Taxonomy Database. 20 June 2022閲覧。 ^ “ar53_r207…10キロバイト (739 語) - 2024年4月17日 (水) 06:10
- 2018年10月11日閲覧。 “NCBI taxonomy page on Archaea” (英語). 米国立生物工学情報センター. 2018年11月5日閲覧。 “GTDB - taxonomy tree” (英語). ゲノム分類データベース. 2018年11月5日閲覧。 ウィクショナリーに関連の辞書項目があります。…153キロバイト (19,965 語) - 2024年10月10日 (木) 05:17
- 23 February 2021閲覧。 ^ “LTP_12_2021 Release Notes”. 23 February 2021閲覧。 ^ “GTDB release 07-RS207”. Genome Taxonomy Database. 20 June 2022閲覧。 ^ “ar53_r207…24キロバイト (1,568 語) - 2023年2月28日 (火) 00:47
- -Remastered 2024- bever_Demo_RoughMix_231021 Wana_Band_Rec_RoughMix_230905 Kozu_GtDB_RoughMix_231002 makeover_Demo_Ver.2 ドライフルーツ_Layer_231206 Hotel Neutrino_Layer_230814…25キロバイト (2,932 語) - 2024年10月10日 (木) 09:31