ファイル:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

高解像度版はありません。

Phylogenetic_tree_of_coronaviruses.jpg (571 × 451 ピクセル、ファイルサイズ: 75キロバイト、MIME タイプ: image/jpeg)

このファイルは、ウィキメディア・コモンズから呼び出されています。
このファイルは、他のプロジェクトで使用されている可能性があります。
このファイルの解説やノートへの記入、履歴などの詳細の確認は、ウィキメディア・コモンズのファイルページ（ノート/履歴/ログ）を使用してください。

ウィキメディア・コモンズのファイルページにある説明を、以下に表示します。

概要

解説Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg	English: Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. Bootstrap values were calculated from 1000 trees. 1118 amino acid positions in Pol were included. The scale bar indicates the estimated number of substitutions per 20 amino acids. All abbreviations for the coronaviruses were the same as those in Figure 1.
日付	2010年8月24日
原典	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/
作者	Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen

ライセンス

このファイルはクリエイティブ・コモンズ表示 3.0 非移植ライセンスのもとに利用を許諾されています。

あなたは以下の条件に従う場合に限り、自由に

共有 – 本作品を複製、頒布、展示、実演できます。
再構成 – 二次的著作物を作成できます。

あなたの従うべき条件は以下の通りです。

表示 – あなたは適切なクレジットを表示し、ライセンスへのリンクを提供し、変更があったらその旨を示さなければなりません。これらは合理的であればどのような方法で行っても構いませんが、許諾者があなたやあなたの利用行為を支持していると示唆するような方法は除きます。

ファイルの履歴

過去の版のファイルを表示するには、その版の日時をクリックしてください。

	日付と時刻	サムネイル	寸法	利用者	コメント
現在の版	2020年3月7日 (土) 02:42		571 × 451 (75キロバイト)	Guest2625	Uploaded a work by Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/ with UploadWizard

ファイルの使用状況

このファイルを使用しているページはありません。

グローバルなファイル使用状況

以下に挙げる他のウィキがこの画像を使っています:

bn.wikipedia.org での使用状況
- করোনাভাইরাস
en-two.iwiki.icu での使用状況
- Coronavirus
fa.wikipedia.org での使用状況
- کروناویروس
fr.wikipedia.org での使用状況
- Coronavirus
ig.wikipedia.org での使用状況
- Nje Korona
sq.wikipedia.org での使用状況
- Koronavirusi
su.wikipedia.org での使用状況
- Koronavirus

メタデータ

このファイルには、追加情報があります (おそらく、作成やデジタル化する際に使用したデジタルカメラやスキャナーが追加したものです)。

このファイルが元の状態から変更されている場合、修正されたファイルを完全に反映していない項目がある場合があります。

画像の説明	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
作者	Patrick C. Y. Woo
短いタイトル	Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis
JPEGファイルのコメント	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
キーワード	coronavirus genome bioinformatics

ファイル:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

概要

ライセンス

キャプション

このファイルに描写されている項目

題材

系統樹

著作権の状況

著作権で保護

利用許諾

クリエイティブ・コモンズ表示 3.0 非移植

成立日

24 8 2010

メディアタイプ

image/jpeg

ファイルの履歴

ファイルの使用状況

グローバルなファイル使用状況

メタデータ