ハクロビア

ハクロビア(Hacrobia)は、SARスーパーグループを含まないクロムアルベオラータの単系統群^[1]として提唱された分類である。ただし、ハクロビアの単系統性については不明で、国際原生生物学会（ISOP）の2019年度の分類ではハクロビアは採用されていない^[2]。なお"ha-"はハプト藻、"-cr-"はクリプト藻に由来し、"-bia"は生物を表す接尾辞である^[3]。ハクロビアの他、CCTH (Cryptophyta, Centrohelida, Telonemia and Haptophyta)^[4]や"Eukaryomonadae"^[5]とも呼ばれる。

研究の歴史

過去にはストラメノパイル、ハプト藻、クリプト藻は、全てクロミスタに分類されていたが^[6]、その後ストラメノパイルは除外され、ハプト藻とクリプト藻は近い関係にあると考えられた^[7]^[8]（そして"Cryptophyta+Haptophyta"グループと総称されることもある）^[9]。2009年の論文では、テロネマ門と中心粒太陽虫を、ハプト藻、クリプト藻と併せて新たな分類を形成することが提案された^[10]。ピコビリ藻もこの分類に入る可能性があるが、情報が少なく確定には至っていなかった^[3]。

出典

^ Okamoto, Noriko; Chantangsi, Chitchai; Horák, Aleš; Leander, Brian S.; Keeling, Patrick J. (2009-09-17). “Molecular Phylogeny and Description of the Novel Katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and Establishment of the Hacrobia Taxon nov” (英語). PLOS ONE 4 (9): e7080. doi:10.1371/journal.pone.0007080. ISSN 1932-6203. PMC 2741603. PMID 19759916.
^ 矢﨑裕規; 島野智之『真核生物の高次分類体系の改訂―Adl et al. (2019)について―』日本動物分類学会、2020年2月29日、75頁。doi:10.19004/taxa.48.0_71。2020年3月24日閲覧。
^ ^a ^b Okamoto N, Chantangsi C, Horák A, Leander BS, Keeling PJ (September 2009). "Molecular phylogeny and description of the novel katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and establishment of the Hacrobia taxon nov". PLoS ONE. 4 (9): e7080. doi:10.1371/journal.pone.0007080. PMID 19759916。
^ Zhao, Sen; Burki, Fabien; Bråte, Jon; Keeling, Patrick J.; Klaveness, Dag; Shalchian-Tabrizi, Kamran (2012). “Collodictyon—An Ancient Lineage in the Tree of Eukaryotes”. Molecular Biology and Evolution 29 (6): 1557–68. doi:10.1093/molbev/mss001. PMC 3351787. PMID 22319147 2012年3月2日閲覧。.
^ “EUKARYOMONADAE”. 2010年7月19日閲覧。
^ Csurös M, Rogozin IB, Koonin EV (May 2008). “Extremely intron-rich genes in the alveolate ancestors inferred with a flexible maximum-likelihood approach”. Mol. Biol. Evol. 25 (5): 903–11. doi:10.1093/molbev/msn039. PMID 18296415.
^ Rice DW, Palmer JD (2006). “An exceptional horizontal gene transfer in plastids: gene replacement by a distant bacterial paralog and evidence that haptophyte and cryptophyte plastids are sisters”. BMC Biol. 4: 31. doi:10.1186/1741-7007-4-31. PMC 1570145. PMID 16956407.
^ Aharon Oren; R. Thane Papke (1 July 2010). Molecular Phylogeny of Microorganisms. Horizon Scientific Press. pp. 190–. ISBN 978-1-904455-67-7 21 January 2011閲覧。
^ Reeb VC, Peglar MT, Yoon HS, et al. (May 2009). “Interrelationships of chromalveolates within a broadly sampled tree of photosynthetic protists”. Mol. Phylogenet. Evol. 53 (1): 202–11. doi:10.1016/j.ympev.2009.04.012. PMID 19398025.
^ Burki, F; Inagaki, Y; Bråte, J; Archibald, J.; Keeling, P.; Cavalier-Smith, T; Sakaguchi, M; Hashimoto, T; Horak, A; Kumar, S; Klaveness, D; Jakobsen, K.S; Pawlowski, J; Shalchian-Tabrizi, K (2009). “Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates.” (Free full text). Genome Biology and Evolution 1: 231–8. doi:10.1093/gbe/evp022. PMC 2817417. PMID 20333193. オリジナルの2012年7月10日時点におけるアーカイブ。.

外部リンク

Tree of Life: Hacrobia

[1] Okamoto, Noriko; Chantangsi, Chitchai; Horák, Aleš; Leander, Brian S.; Keeling, Patrick J. (2009-09-17). “Molecular Phylogeny and Description of the Novel Katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and Establishment of the Hacrobia Taxon nov” (英語). PLOS ONE 4 (9): e7080. doi:10.1371/journal.pone.0007080. ISSN 1932-6203. PMC 2741603. PMID 19759916.

[:1-2] 矢﨑裕規; 島野智之『真核生物の高次分類体系の改訂―Adl et al. (2019)について―』日本動物分類学会、2020年2月29日、75頁。doi:10.19004/taxa.48.0_71。2020年3月24日閲覧。

[okamoto2009-3] Okamoto N, Chantangsi C, Horák A, Leander BS, Keeling PJ (September 2009). "Molecular phylogeny and description of the novel katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and establishment of the Hacrobia taxon nov". PLoS ONE. 4 (9): e7080. doi:10.1371/journal.pone.0007080. PMID 19759916。

[ZhaoBurkBratKeel12-4] Zhao, Sen; Burki, Fabien; Bråte, Jon; Keeling, Patrick J.; Klaveness, Dag; Shalchian-Tabrizi, Kamran (2012). “Collodictyon—An Ancient Lineage in the Tree of Eukaryotes”. Molecular Biology and Evolution 29 (6): 1557–68. doi:10.1093/molbev/mss001. PMC 3351787. PMID 22319147 2012年3月2日閲覧。.

[urlEUKARYOMONADAE-5] “EUKARYOMONADAE”. 2010年7月19日閲覧。

[pmid18296415-6] Csurös M, Rogozin IB, Koonin EV (May 2008). “Extremely intron-rich genes in the alveolate ancestors inferred with a flexible maximum-likelihood approach”. Mol. Biol. Evol. 25 (5): 903–11. doi:10.1093/molbev/msn039. PMID 18296415.

[pmid16956407-7] Rice DW, Palmer JD (2006). “An exceptional horizontal gene transfer in plastids: gene replacement by a distant bacterial paralog and evidence that haptophyte and cryptophyte plastids are sisters”. BMC Biol. 4: 31. doi:10.1186/1741-7007-4-31. PMC 1570145. PMID 16956407.

[OrenPapke2010-8] Aharon Oren; R. Thane Papke (1 July 2010). Molecular Phylogeny of Microorganisms. Horizon Scientific Press. pp. 190–. ISBN 978-1-904455-67-7 21 January 2011閲覧。

[pmid19398025-9] Reeb VC, Peglar MT, Yoon HS, et al. (May 2009). “Interrelationships of chromalveolates within a broadly sampled tree of photosynthetic protists”. Mol. Phylogenet. Evol. 53 (1): 202–11. doi:10.1016/j.ympev.2009.04.012. PMID 19398025.

[10] Burki, F; Inagaki, Y; Bråte, J; Archibald, J.; Keeling, P.; Cavalier-Smith, T; Sakaguchi, M; Hashimoto, T; Horak, A; Kumar, S; Klaveness, D; Jakobsen, K.S; Pawlowski, J; Shalchian-Tabrizi, K (2009). “Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates.” (Free full text). Genome Biology and Evolution 1: 231–8. doi:10.1093/gbe/evp022. PMC 2817417. PMID 20333193. オリジナルの2012年7月10日時点におけるアーカイブ。.

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