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ハプログループC (Y染色体)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
Y染色体 C 系統

ハプログループCの拡散経路
系統祖 C-M130
発生時期 60,000年前以前
発生地(推定) 西南アジア
親階層 CF
分岐指標 M130/RPS4Y711, P184, P255, P260
子階層 C1C2

ハプログループC-M130 (Y染色体)(ハプログループC-M130 Yせんしょくたい、: Haplogroup C (Y-DNA))とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ(型集団)の分類で、UEPs M130/RPS4Y711, P184, P255, およびP260によって定義されるグループである。

拡散経路

[編集]

崎谷満は現生人類は出アフリカ後、南ルート、北ルート、西ルートの3方向に拡散したとしており、Y染色体ハプログループCの下位系統(の祖型)はそれぞれ分かれて別ルートを進んだ[1]

  • 南ルート:C1b2(C-B477)
  • 北ルート:C2(C-M217)、C1a1(C-M8)
  • 西ルート:C1a2(C-V20/V184)

一塩基多型分岐図

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A0000
 
A000-T
 
PR2921
 
A00
 
 
A0
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
L1090
 
 
P305
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A1a
 
 
A1b1
 
 
サン族
 
 
 
 
 
 
PF1608
 
 
BY22527.2
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
V221
 
 
M42
 
 
M168
 
YAP
 
 
M216
 
 
M174
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
P143
 
M89
 
F1329
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M130
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M578
 
L15
 
M9 (P128)
 
M526
 
M2308
 
F549
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
G系統
 
 
H系統
 
 
 
 
 
 
 
LT系統
 
 
YSC0000186
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
IJ系統
 
I系統
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
J系統
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
F3393
 
CTS11043
 
M8
 
CTS9336
 
CTS6678
 
Z7972
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Y170131
 
Y170130
 
 
 
 
 
 
 
M217
 
F1067
 
Z1312
 
F2613
 
CTS4021
 
CTS2657
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CTS11990
 
Z31664
 
Y112121
 
MF1792
 
 
 
 
 
 
Z31665
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CTS3579
 
 
 
 
 
 
MF2816
 
Y86025
 
 
Y87983
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Y89130
 
MF2828
 
 
 
 
 

(出典)"Y-Full"(Ver.12.00), "FTDNA Big Y Tree"

下位区分

[編集]

ISOGG系統樹 2020年7月11日版による

脚注

[編集]
  1. ^ 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』(勉誠出版 2009年)
  2. ^ Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  3. ^ Shoji Totsuka, The Super Science High School Consortium, Youichi Sato, and Masashi Tanaka, "A study of the geographic distribution of Y chromosomal and mitochondrial DNA haplogroups in Japanese population by Super Science High School Consortium (SSH)." Anthropological Science (Japanese Series) Vol. 124(2), 85–91, 2016.
  4. ^ a b YFull Haplogroup YTree v5.05 at 30 July 2017
  5. ^ Scozzari R, Massaia A, D'Atanasio E, Myres NM, Perego UA et al. (2012). "Molecular Dissection of the Basal Clades in the Human Y Chromosome Phylogenetic Tree". PLoS ONE 7 (11): e49170. doi:10.1371/journal.pone.0049170. PMC 3492319. PMID 23145109.
  6. ^ a b c d ISOGG Y-DNA Haplogroup C and its Subclades - 2017 (Accessed August 26, 2017)
  7. ^ Pille Hallast, Chiara Batini, Daniel Zadik, et al., "The Y-Chromosome Tree Bursts into Leaf: 13,000 High-Confidence SNPs Covering the Majority of Known Clades." Molecular Biology and Evolution doi:10.1093/molbev/msu327 Advance Access publication December 2, 2014.
  8. ^ Gayden, Tenzin; Cadenas, Alicia M.; Regueiro, Maria; Singh, NB; Zhivotovsky, LA; Underhill, PA; Cavalli-Sforza, LL; Herrera, RJ (2007). "The Himalayas as a Directional Barrier to Gene Flow". American Journal of Human Genetics 80 (5): 884–894. doi:10.1086/516757. PMC 1852741. PMID 17436243.
  9. ^ Hudjashov G, Kivisild T, Underhill PA et al. (May 2007). "Revealing the prehistoric settlement of Australia by Y chromosome and mtDNA analysis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (21): 8726–30. doi:10.1073/pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.
  10. ^ Xue Y, Zerjal T, Bao W et al. (April 2006). "Male demography in East Asia: a north-south contrast in human population expansion times". Genetics 172 (4): 2431–9. doi:10.1534/genetics.105.054270. PMC 1456369. PMID 16489223.
ヒトY染色体ハプログループ系統樹
Y染色体アダム (Y-MRCA)
A0 A1
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J K1 K2
L T MS NO P K2*
N O Q R