フランキア目
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フランキア目 | ||||||||||||
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分類 | ||||||||||||
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学名 | ||||||||||||
Frankiales Sen et al. 2014[1] (IJSEMリストに記載 2015[2]) | ||||||||||||
タイプ属 | ||||||||||||
フランキア属 Frankia Brunchorst 1886[3] (IJSEMリストに記載 1980[4]) | ||||||||||||
下位分類(科)[10] | ||||||||||||
過去に分類されていた科
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フランキア目(Frankiales)は真正細菌の放線菌門放線菌綱の目の一つである[11]。
解説
[編集]非運動性のグラム陽性菌。多房胞子嚢を形成し、ほとんどの細胞は細胞壁の厚い小胞を形成する。窒素を固定し、放線菌根性植物(actinorhizal plant)に根粒を形成する。
フランキア目は正式承認される以前から放線菌綱(Actinomycetales)の下位分類項目として用いられており、Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology第5版ではフランキア科(Frankiaceae)、ゲオデルマトフィラス科(Geodermatophilaceae)、ナカムレラ科(Nakamurellaceae)、スポリティヤ科(Sporichthyaceae)、アシドサーマス科(Acidothermaceae)及びクリプトスポランジウム科(Cryptosporangiaceae)の6科11属を有するとされていた[12]。2014年に放線菌綱の本格的な16S rRNA遺伝子配列解析による分類体系の調査結果が公表され、フランキア科を持つ目としてIJSEMリストに記載され、他の科については、同時に新たに提案された他の目、ゲオデルマトフィラス目(Geodermatophilales)、アシドサーマス目(Acidothermales)、ナカムレラ目(Nakamurellales)のいずれかに移動した[1]。
脚注
[編集]- ^ a b Arnab Sen, Vincent Daubin, Danis Abrouk, Isaac Gifford, Alison M. Berry, Philippe Normand (01 November 2014). “Phylogeny of the class Actinobacteria revisited in the light of complete genomes. The orders ‘Frankiales’ and Micrococcales should be split into coherent entities: proposal of Frankiales ord. nov., Geodermatophilales ord. nov., Acidothermales ord. nov. and Nakamurellales ord. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt_11): 3821-3832. doi:10.1099/ijs.0.063966-0. PMID 25168610.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 February 2015). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 64, part 11, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_2): 323-324. doi:10.1099/ijs.0.000017.
- ^ Brunchorst J. (1886). “Über einige Wurzelanschwellungen, besonders diejenigen von Alnus und den Elaegnaceen”. Untersuchungen aus dem botanischen Institut in Tübingen. 2. pp. 151-177
- ^ a b V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225.
- ^ J. H. BECKING (01 April 1970). “Frankiaceae fam. nov. (Actinomycetales) with one new combination and six new species of the genus Frankia Brunchorst 1886, 174”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 20 (2): 201-220. doi:10.1099/00207713-20-2-201.
- ^ Yu-Zhou Feng, Wei-Xun Chunyu, Rui Liang, Richard L. Hahnke, Peter Schumann, Yu-Rong Zhao, Sheng Gao, Min Yin, Yang Ji, Le Sun, Xiao-Yang Zhi & Shu-Kun Tang (05 November 2020). “Vallicoccus soli gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from soil, and description of Vallicoccaceae fam. nov., Motilibacterales ord. nov.”. Antonie van Leeuwenhoek 113 (12): 2155–2165. doi:10.1007/s10482-020-01484-5. PMID 33151459.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 October 2021). “Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (9): 4943. doi:10.1099/ijsem.0.004943.
- ^ Soon Dong Lee (01 October 2013). “Proposal of Motilibacteraceae fam. nov., with the description of Motilibacter rhizosphaerae sp. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 63 (Pt_10): 3818-3822. doi:10.1099/ijs.0.052357-0. PMID 23667142.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 January 2014). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations and new taxonomic opinions have appeared in volume 63, part 10, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt_1): 6-7. doi:10.1099/ijs.0.059436-0.
- ^ “Order Frankiales”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年2月7日閲覧。
- ^ Sen A, Daubin V, Abrouk D, Gifford I, Berry AM, Normand P. (2014). “Phylogeny of the class Actinobacteria revisited in the light of complete genomes. The orders 'Frankiales' and Micrococcales should be split into coherent entities: Proposal of Frankiales ord. nov., Geodermatophilales ord. nov., Acidothermales ord. nov. and Nakamurellales ord. nov.”. Int J Syst Evol Microbiol 64 (Pt 11): 3821–3832. doi:10.1099/ijs.0.063966-0. PMID 25168610.
- ^ Wolfgang Ludwig, Jean Euzéby, Peter Schumann, Hans-Jürgen Busse, Martha E. Trujillo, Peter Kämpfer & William B. Whitman (2012). “Road map of the phylum Actinobacteria”. Bergey’s Manual® of Systematic Bacteriology. Springer (New York). pp. 1–28. doi:10.1007/978-0-387-68233-4_1. ISBN 978-0-387-95043-3