マウスバンク
マウスバンク[1](英:Mouse Repository)とは、遺伝子改変マウスの作製、収集、保管、供給を行う研究施設である。
遺伝子改変マウスには、外部から特定の遺伝子を導入したトランスジェニックマウス(遺伝子改変動物)や遺伝子を欠損させたノックアウトマウスなどがあり、遺伝子の機能や人間が病気になる原因を調べたり、薬の開発において有効性を調べるモデル動物(ヒト疾患モデルマウス)として利用されている。マウスバンクは、マウスリソースに関する情報や試料を管理することで、生命科学研究における遺伝子改変マウスの利活用を促進し、持続的な研究活動を支える研究基盤になっている。
マウスバンクでは、遺伝子改変マウスを効率的に管理するために生殖工学技術が活用され、凍結保存した受精卵や精子を液体窒素中で保管している。遺伝子改変マウスの受精卵や精子を凍結保存することで、研究者が必要な時に体外受精や胚移植により個体を復元し、速やかに研究に使用することができる。また、遺伝子改変マウスを生体として飼育する必要が無いため、動物実験の基本原則である3Rsにおける動物の削減(英:Reduction)にも貢献している。
マウスバンクは、世界中に創設[2]されており、代表的な研究機関として米国のジャクソン研究所(英:Jackson Laboratory)やカリフォルニア大学デービス校マウスバイオロジープログラム(英:UC Davis Mouse Biology Program[3])、英国のMRCハーウェル研究所マリー・ライオンセンター(英:Mary Lyon Centre[4])、日本では熊本大学生命資源研究・支援センター動物資源開発研究施設[5](Center for Animal Resources and Development, CARD)および理化学研究所バイオリソース研究センター[6]が知られている。
米国におけるマウスバンク組織としてMutant Mouse Regional Resource Centers (MMRRC)[7]、欧州における マウスバンク組織としてEuropean Mouse Mutant Archive(EMMA)[8]、アジアにおけるマウスバンク組織としてAsian Mouse Mutagenesis and Resource Association (AMMRA)[9][10]、豪州のAustralian Phenomics Facilities(APF)[11]がある。
マウスバンクは国際的に連携しており、各マウスバンクに保管されている遺伝子改変マウスの情報を共有し、International Mouse Strain Resource(IMSR)[12][13]から検索できるようになっている。研究者は、IMSRで見つけた遺伝子改変マウスをマウスバンクから入手することができる。現在、IMSRでは、80,443系統[14]の遺伝子改変マウスを管理している。
研究者がマウスバンクに寄託した遺伝改変マウスは、マウスに関する遺伝子などの情報がマウスバンクのデータベースに登録され、論文で使用された資源を特定する研究資源識別子であるRRID[15](英:Research Resource Identifier[16][17])が賦与される。RRIDは、研究資源の特定・発見・利用を促進を目的とており、生物リソースを特定するための標準的なフォーマットである。論文に使用した遺伝子改変マウスなどの生物材料のRRIDの引用が、研究の再現性や持続性を向上させる取り組みとしてNature誌などの学術誌で推奨されている[18]。
医学・生命科学における遺伝子改変動物を用いた研究の再現性、信頼性、完全性を高める国際的な取り組みとして、Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines(LAG-Rガイドライン)[19]が策定され、マウスバンクにおける試料の保管やIDの管理が推奨されている。
IMSRに参加する機関および組織
[編集]Mouse Repository | Holdings |
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Australian Phenome Bank (APB)
Australian Phenomics Facility The Australian National University 117 Garran Road , Acton ACT 2601 Australia |
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Animal Resources Centre (ARC)
Farm Road Murdoch, Western Australia 6164 Australia |
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Center for Animal Resources and Development (CARD)
Kumamoto University 2-2-1 Honjo Kumamoto, 860-0811 Japan |
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Cornell Heart Lung Blood Resource for Optogenetic Mouse Signaling (CHROMus)
Cornell University T4002 VRT 618 Tower Road Ithaca, NY 14853 USA |
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Canadian Mouse Mutant Repository (CMMR)
25 Orde Street Toronto, Ontario M5T 3H7 Canada |
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Cam-Su Genomic Resource Center (Cmsu)
Soochow University 199 Renai Road Suzhou, Jiangsu 215123 P.R. China |
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Charles River Laboratories (CRL)
251 Ballardvale Road Wilmington, MA 01887 USA |
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Cystic Fibrosis Mouse Model Core (CWR)
Case Western Reserve University 2109 Adelbert Road Cleveland, OH 44106-4948 USA |
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European Mouse Mutant Archive (EMMA)
Helmholtz Zentrum München - German Research Center for Environmental Health, GmbH Institute of Experimental Genetics Ingolstädter Landstraße 1 Neuherberg / München, 85764 Germany |
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Dr. Elizabeth M. Simpson, Ph.D. (EMS)
Centre for Molecular Medicine and Therapeutics University of British Columbia 950 West 28th Avenue Vancouver, B.C. V5Z 4H4 Canada |
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Envigo an Inotiv Company (ENV)
8520 Allison Pointe Blvd Suite 400 Indianapolis, IN 46250 USA |
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European Mouse Mutant Cell Repository (EuMMCR)
Helmholtz Zentrum München Ingolstädter Landstraße 1 München, 85764 Germany |
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genOway (GENO)
31 Rue Saint Jean de Dieu Lyon, 69007 France |
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GemPharmatech (GPT)
12 Xuefu Road, Pukou High-Tech District Nanjing, 210061 P.R. China |
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MRC Harwell (HAR)
Harwell Science and Innovation Campus , Oxfordshire OX11 0RD UK |
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JAX Mice and Services (JAX)
610 Main Street Bar Harbor, ME 04609 USA |
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CLEA Japan, Inc. (JCL)
1-2-7 Higashiyama, Meguro-ku Tokyo, 153-8533 Japan |
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Korea Mouse Phenotyping Center (KMPC)
520ho 81Dong Seoul National University Seoul, Republic of Korea |
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Mutant Mouse Regional Resource Centers (MMRRC)
Mouse Biology Program 2795 Second Street, Suite 400 Davis, CA 95618 USA |
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National Cancer Institute at Frederick (NCIMR)
P.O. Box B, Thompson & Beasley Drive Building 1021, Room 10 Frederick, MD 21702 USA |
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National Institute of Genetics (NIG)
Mammalian Genetics Laboratory 1111 Yata Mishima, Shizuoka 411-8540 Japan |
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Oriental BioService, Inc. (OBS)
Minamiyamashiro Laboratory 181 Minamiyamashiro-mura Souraku-gun, Kyoto 619-1401 Japan |
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Oak Ridge Collection at JAX (ORNL)
The Jackson Laboratory 600 Main Street Bar Harbor, ME 04609 USA |
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RIKEN BioResource Research Center (RBRC)
RIKEN BRC 3-1-1 Koyadai Tsukuba, Ibaraki 305-0074 Japan |
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National Applied Research Laboratories (RMRC-NLAC)
128 Academic Road Sec 2 Nankang, Taipei 11529 Taiwan, R.O.C. |
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Shanghai Model Organisms Center, Inc. (SMOC)
3rd Floor, Building 2, No 178 Banxia Road Pudong New District, Shanghai 201318 P.R. China |
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Taconic Biosciences (TAC)
One Hudson City Centre Hudson, NY 12534 USA |
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Texas A&M Institute for Genomic Medicine (TIGM)
670 Raymond Stotzer Pkwy 4485 TAMU College Station, TX 77843-4485 USA |
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University of North Carolina, Chapel Hill - Systems Genetics Core (UNC)
120 Mason Farm Road 5047 Genetic Medicine Building, CB #7264 University of North Carolina, Chapel Hill Chapel Hill, NC 27599-7264 USA |
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Vanderbilt Cryopreserved Mouse Repository (VCMR)
2213 Garland Avenue 9410 MRB IV Nashville, TN 37232-0494 USA |
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Summary Report: |
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参照
[編集]- ^ 直己, 中潟「マウスバンク」『日本薬理学雑誌』第129巻第5号、2007年、343–348頁、doi:10.1254/fpj.129.343。
- ^ Donahue, Leah Rae; Hrabe de Angelis, Martin; Hagn, Michael; Franklin, Craig; Lloyd, K. C. Kent; Magnuson, Terry; McKerlie, Colin; Nakagata, Naomi et al. (2012-10). “Centralized mouse repositories” (英語). Mammalian Genome 23 (9-10): 559-571. doi:10.1007/s00335-012-9420-4. ISSN 0938-8990. PMC 3709583. PMID 22945696 .
- ^ UC Davis Mouse Biology Program
- ^ Mary Lyon Centre
- ^ 熊本大学生命資源研究・支援センター動物資源開発研究施設
- ^ 理化学研究所バイオリソース研究センター
- ^ Mutant Mouse Regional Resource Centers (MMRRC)
- ^ European Mouse Mutant Archive(EMMA)
- ^ Asian Mouse Mutagenesis and Resource Association (AMMRA)
- ^ Chin, Hsian-Jean; Dobbie, Michael S.; Gao, Xiang; Hennessy, James E.; Nam, Ki-Hoan; Seong, Je Kyung; Shiroishi, Toshihiko; Takeo, Toru et al. (2022). “Asian Mouse Mutagenesis Resource Association (AMMRA): mouse genetics and laboratory animal resources in the Asia Pacific”. Mammalian Genome 33 (1): 192–202. doi:10.1007/s00335-021-09912-1. ISSN 0938-8990. PMC 8418786. PMID 34482437 .
- ^ Australian Phenomics Facilities(APF)
- ^ International Mouse Strain Resource(IMSR)
- ^ Eppig, Janan T.; Motenko, Howie; Richardson, Joel E.; Richards-Smith, Beverly; Smith, Cynthia L. (2015). “The International Mouse Strain Resource (IMSR): cataloging worldwide mouse and ES cell line resources”. Mammalian Genome 26 (9-10): 448–455. doi:10.1007/s00335-015-9600-0. ISSN 0938-8990. PMC 4602064. PMID 26373861 .
- ^ 80,443系統
- ^ RRID
- ^ Research Resource Identifier, RRID
- ^ Singh Chawla, Dalmeet (2015-05-29). “Researchers argue for standard format to cite lab resources” (英語). Nature. doi:10.1038/nature.2015.17652. ISSN 1476-4687 .
- ^ “Reporting standards and availability of data, materials, code and protocols | Nature Portfolio” (英語). www.nature.com. 2022年6月4日閲覧。
- ^ Teboul, Lydia; Amos-Landgraf, James; Benavides, Fernando J.; Birling, Marie-Christine; Brown, Steve D. M.; Bryda, Elizabeth; Bunton-Stasyshyn, Rosie; Chin, Hsian-Jean et al. (2024-07-02). “Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines” (英語). Nature Communications 15 (1): 5574. doi:10.1038/s41467-024-49439-y. ISSN 2041-1723. PMC PMC11220107. PMID 38956430 .