利用者:Takaba0113/生物分類の一覧

生物分類の一覧（せいぶつぶんるいのいちらん）は分類学における生物分類を列記したもの。

なお、扱う階級は超界から目で、科や属、種は扱わない。

生物 ドメイン 界 門 綱 目 科 属 種

超界から界

生物	細菌超界		細菌界
	古細菌超界		ユリアーケオタ界
			クレンアーケオタ界
			所属不明
	真核生物超界	アメーバ動物上界	アメーバ界
		オピストコンタ上界	動物界
			菌界
		バイコンタ上界	リザリア界
			エクスカヴァータ界
			アルベオラータ界
			クリプト生物界
			ストラメノパイル界
			植物界
			所属不明

本項での"界"の扱い

分類学では長らく界の定義に揺らぎがある。二界説や三界説なども唱えられているが、本項では現在唱えられる広義の界を用いる。

→詳細は「界 (分類学)」を参照

界から門

細菌界/Bacteria

細菌超界	細菌界

界	亜界	枝	下界	上門	門
細菌界	ネジバクテリア亜界		エオバクテリア下界		デイノコックス門
					クロロフレクスス門
			グリコバクテリア下界		シアノバクテリア門
					スピロケータ門
					フィブロバクター門
					ゲマティモナス門
					クロロビウム門
					バクテロイデス門
					プランクトミセス門
					クラミジア門
					ヴェルコミクロビウム門
					レンティスファエラ門
					プロテオバクテリア門
					アシドバクテリウム門
					アキフェックス門
					デフェリバクター門
					テルモデスルフォバクテリウム門
					ニトロスピラ門
					フソバクテリウム門
					シネルギステス門
					カルディセリクム門
			所属不明		エルシミクロビウム門
					アルマティモナス門
	ポジバクテリア亜界				テルモトガ門
					グラム陽性細菌門
					テネリクテス門
					放線菌門
					ディクチオグロムス門
	所属不明				クリシオゲネス門
					所属不明

ユリアーケオタ界/Euryarchaeota

古細菌超界	ユリアーケオタ界     クレンアーケオタ界     所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
ユリアーケオタ界					ユリアーケオタ門

クレンアーケオタ界/Crenarchaeota

古細菌超界	ユリアーケオタ界     クレンアーケオタ界     所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
クレンアーケオタ界					クレンアーケオタ門

所属不明（古細菌超界下）

古細菌超界	ユリアーケオタ界     クレンアーケオタ界     所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
所属不明					タウモアーケオタ門

アメーバ界/Amoebobiota

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
アメーバ界					アメーバ動物門

動物界/Animalia

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
動物界	アメービディウム亜界				アメービディウム門
	コドシガ亜界				襟鞭毛虫門
	ファゴシテロゾア亜界				平板動物門
	海綿動物亜界				海綿動物門
	ヒドラ亜界				刺胞動物門
	有櫛動物亜界				有櫛動物門
	左右相称動物亜界	前口動物枝		冠輪動物上門	扁形動物門
					紐形動物門
					輪形動物門
					軟体動物門
					環形動物門
					内肛動物門
					外肛動物門
					有輪動物門
					腕足動物門
					菱形動物門
					直泳動物門
					腹毛動物門
					顎口動物門
					微顎動物門
				脱皮動物上門	線形動物門
					類線形動物門
					鰓曳動物門
					胴甲動物門
					動吻動物門
					緩歩動物門
					有爪動物門
					節足動物門
				所属不明	毛顎動物門
		後口動物枝			「珍無腸動物門」
					半索動物門
					棘皮動物門
					脊索動物門
	所属不明				一胚葉動物門
					所属不明

菌界/Fungi

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
菌界	ディカリア亜界				子嚢菌門
					担子菌門
	所属不明				ツボカビ門
					ネオカリマスティクス菌門
					コウマクノウキン門
					微胞子虫門
					グロムス菌門
					所属不明

リザリア界/Rhizaria

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
リザリア界					アメーバ鞭毛虫門
					有孔虫門
					放散虫門

エクスカヴァータ界/Excavata

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
エクスカヴァータ界					ペルコロモナス門
					ロウコゾア門
					ユーグレナ動物門
					メタモナーダ門

アルベオラータ界/Alveolatobiontes

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
アルベオラータ界					渦鞭毛動物門
					アピコンプレックス門
					クロメラ門
					繊毛虫門

クリプト生物界/Cryptobiontes

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
クリプト生物界					カタブレファリス門
					クリプト植物門

ストラメノパイル界/Straminipila

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
ストラメノパイル界					ラビリンチュラ菌門
					ビコソエカ門
					オパリナ門
					偽菌門
					オクロ植物門
					所属不明

植物界/Plantae

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
植物界	緑色植物亜界		緑藻植物下界		緑藻植物門
			ストレプト植物下界		メソスティグマ藻植物門
					クロロキブス藻植物門
					クレブソルミディウム藻植物門
					ホシミドロ藻植物門
					コレオケーテ藻植物門
					車軸藻植物門
					ゼニゴケ植物門
					ツノゴケ植物門
					マゴケ植物門
					維管束植物門
					所属不明
			所属不明
	紅色植物亜界				紅色植物門
					灰色植物門

所属不明（バイコンタ上界下）

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

界	亜界	枝	下界	上門	門
所属不明					太陽虫門
					ハプト植物門
					テロネマ門
					ピコゾア門

所属不明（真核生物超界下）

真核生物超界	アメーバ動物上界   アメーバ界     オピストコンタ上界   動物界     菌界     バイコンタ上界   リザリア界     エクスカヴァータ界     アルベオラータ界     クリプト生物界     ストラメノパイル界     植物界     所属不明       所属不明

上界	界	亜界	枝	下界	上門	門
所属不明						アプソゾア門
						所属不明

門から目

ディノコックス門

門	綱	亜綱	目
デイノコックス門	デイノコックス綱		デイノコックス目
			テルムス目

クロロフレクスス門

門	綱	亜綱	目
クロロフレクスス門	クロロフレクスス綱		クロロフレクスス目
			ヘルペトシフォン目
	アナエロリネア綱		アナエロリネア目
	カルディリネア綱		カルディリネア目
	テルモミクロビウム綱		テルモミクロビウム目
			スファエロバクター目
	クテドノバクター綱		クテドノバクター目
			テルモゲマティスポラ目

シアノバクテリア門

門	綱	亜綱	目
シアノバクテリア門	グロエオバクター綱		グロエオバクター目
	ネンジュモ綱	シネココックス亜綱	シネココックス目
		ネンジュモ亜綱	クロオコックス目
			ユレモ目
			ネンジュモ目
		所属不明	シュードアナベナ目

参考文献

• 生物分類表（仲田崇志）http://www2.tba.t-com.ne.jp/nakada/takashi/taxonomy/taxonomy.html
• Adrianov, A. V. Current problems in marine biodiversity studies. Russ. J. Mar. Biol. 30, S1-S16 (2004).
• Boone, D. R., Castenholz, R. W. & Garrity, G. M. (eds.) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 1. (Springer-Verlag, New York, 2001).
• Brochier-Armanet, C., Boussau, B., Gribaldo, S. & Forterre, P. Mesophilic crenarchaeota: Proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota. Nat. Rev. Microbiol. 6, 245-252 (2008).
• Brusca, R. C. & Brusca, G. J. Invertebrates, 2nd Edn. (Sinauer, Sunderland, 2003).
• Cavalier-Smith, T. Kingdom Protozoa and its 18 phyla. Microbiol. Rev. 57, 953-994 (1993).
• Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73, 203-266 (1998).
• Cavalier-Smith, T. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52, 7-76 (2002a).
• Cavalier-Smith, T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52, 297-354 (2002b)
• Cavalier-Smith, T. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol. Direct 1, 19 (2006).
• Cho, J.-C., Vergin, K. L., Morris, R. M. & Giovannoni, S. J. Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, a transparent exopolymer producing marine bacterium, and the description of a novel bacterial phylum, Lentisphaerae. Environ. Microbiol. *6, 611-621 (2004).
• Doweld, A. Prosyllabus Tracheophytorum (GEOS, Moscow, 2001).
• Garrity, G. M., Bell, J. A. & Lilburn, T. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 2. (eds. Brenner, D. J., Krieg, N. R. & Staley, J. T.) 159-220 (Springer-Verlag, New York, 2005).
• Geissinger, O., Herlemann, D. P. R., Mörschel, E., Maier, U. G. & Brune, A. The ultramicrobacterium “Elusimicrobium minutum” gen. nov., sp. nov., the first cultivated representative of the Termite Group 1 phylum. Appl. Environ. Microbiol. 75, 2831-2840 (2009).
• Halanych, K. M. The new view of animal phylogeny. Annu. Rev. Ecol. Evol. Syst. 35, 229-256 (2004).
• Hibbett, D. S. et al. A higher-level phylogenetic classification of the Fungi. Mycol. Res. 111, 509-547 (2007).
• Hugenholtz, P. & Stackebrandt, E. Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended *description). Int. J. Syst. Microbiol. 54, 2049-2051 (2004).
• Jumas-Bilak, E., Roudière, L. & Marchandin, H. Description of ‘Synergistetes’ phyl. nov. and emended description of the phylum ‘Deferribacteres’ and of the family Syntrophomonadaceae, phylum ‘Firmicutes’. Int. J. Syst. Evol. *Microbiol. 59, 1028-1035 (2009).
• 片倉晴雄 および 馬渡峻輔 編 シリーズ 21 世紀の動物科学 2: 動物の多様性 (培風館, 東京, 2007).
• Krieg, N. R., Ludwig, W., Euzáby, J. & Whitman, W. B. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 4, The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, *Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes (eds. Krieg, N. R. et al.) 25 (Springer, New York, 2011).
• Margulis, L. & Schwartz, K. V. Five Kingdoms: an Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth. 3rd ed. (Henry Holt and Company, New York, 1998).
• Minelli, A. Perspectives in Animal Phylogeny and Evolution (Oxford University Press, Oxford, 2009).
• Moore, R. B. et al. A photosynthetic alveolate closely related to apicomplexan parasites. Nature 451, 959-963 (2008).
• Mori, K., Yamaguchi, K., Sakiyama, Y., Urabe, T. & Suzuki, K. Caldisericum exile gen. nov., sp. nov., an anaerobic, thermophilic, filamentous bacterium of a novel bacterial phylum, Caldiserica phyl. nov., originally called the candidate phylum *OP5, and description of Caldisericaceae fam. nov., Caldisericales ord. nov. and Caldisericia classis nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 2894-2898 (2009).
• Murray, R. G. E. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Vol. 1. (eds. Krieg, N. R. & Holt, J. G.) 31-34 (Williams and Wilkins, Baltimore, 1984).
• Okamoto, N. & Inouye, I. The katablepharids are a distant sister group of the Cryptophyta: A proposal for Katablepharidophyta divisio nova/ Katablepharida phylum novum based on SSU rDNA and beta-tubulin phylogeny. Protist 156, 163-179 (2005).
• Petrov, N. B., Aleshin, V. V., Pegova, A. N., Ofitserov, M. V. & Slyusarev, G. S. New insight into the phylogeny of Mesozoa: Evidence from the 18S and 28S rRNA genes. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 65, 167-169 (2010).
• Philippe, H. et al. Acoelomorph flatworms are deuterostomes related to Xenoturbella. Nature 470, 255-258 (2011).
• Saunders, G. W. & Hommersand, M. H. Assessing red algal supraordinal diversity and taxonomy in the context of contemporary systematic data. Am. J. Bot. 91, 1494-1507 (2004).
• Schleifer, K.-H. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 3, The Firmicutes (eds. De Vos, P. et al.) 19 (Springer, Dordrecht, 2009).
• Seenivasan, R., Sausen, N., Medlin, L. K. & Melkonian, M. Picomonas judraskeda gen. et sp. nov.: The first identified member of the Picozoa phylum nov., a widespread group of picoeukaryotes, formerly known as ‘picobiliphytes.’ PLoS ONE 8, e59565 (2013).
• Stechmann, A., Cavalier-Smith, T. Rooting the eukaryote tree by using a derived gene fusion. Science 297, 89-91 (2002).
• Tamaki, H. et al. Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 1442-1447 (2011).
• Telford, M. J. Animal phylogeny. Curr. Biol. 23, R981-R985 (2006).
• Woese, C. R., Kandler, O. & Wheelis, M. L. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 4576-4579 (1990).
• Zrzavý, J., Mihulka, S., Kepka, P., Bezděk, A. & Tietz, D. Phylogeny of the Metazoa based on morphological and 18S ribosomal DNA evidence. Cladistics 14, 249-285 (1998).

• Albuquerque, L. et al. Gaiella occulta gen. nov., sp. nov., a novel representative of a deep branching phylogenetic lineage within the class Actinobacteria and proposal of Gaiellaceae fam. nov. and Gaiellales ord. nov. Syst. Appl. Microbiol. 34, 595-599 (2011).
• Antunes, A. et al. A new lineage of halophilic, wall-less, contractile bacteria from a brine-filled deep of the Red Sea. J. Bacteriol. 190, 3580-3587 (2008).
• Cavaletti, L. et al. New lineage of filamentous, spore-forming, gram-positive bacteria from soil. Appl. Environ. Microbiol. 72, 4360-4369 (2006).
• Cavalier-Smith, T. Kingdom Protozoa and its 18 phyla. Microbiol. Rev. 57, 953-994 (1993).
• Cavalier-Smith, T. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52, 7-76 (2002).
• Cavalier-Smith, T. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol. Direct 1, 19 (2006).
• 千原光雄 藻類多様性の生物学 (内田老鶴圃, 東京, 1997).
• Cho, J.-C., Vergin, K. L., Morris, R. M. & Giovannoni, S. J. Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, a transparent exopolymer producing marine bacterium, and the description of a novel bacterial phylum, Lentisphaerae. Environ. Microbiol. 6, 611-621 (2004).
• Cho, Y.-J., Lee, K., Song, J. & Cho, J.-C. Puniceicoccus vermicola gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium, and description of Puniceicoccaceae fam. nov., Puniceicoccales ord. nov., Opitutaceae fam. nov., Opitutales ord. nov. and Opitutae classis nov. in the phylum 'Verrucomicrobia'. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57, 532-537 (2007).
• Fukunaga, Y., Kurahashi, M., Yanagi, K., Yokota, A. & Harayama, S. Acanthopleuribacter pedis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium isolated from a chiton, and description of Acanthopleuribacteraceae fam. nov., Acanthopleuribacterales ord. nov., *Holophagaceae fam. nov., Holophagales ord. nov. and Holophagae classis nov. in the phylum ‘Acidobacteria’. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 58, 2597-2601 (2008).
• Fukunaga, Y. et al. Phycisphaera mikurensis gen. nov., sp. nov., isolated from a marine alga, and proposal of Phycisphaeraceae fam. nov., Phycisphaerales ord. nov. and Phycisphaerae classis nov. in the phylum Planctomycetes. J. Gen. Appl. Microbiol. 55, 267-275 (2009).
• Garrity, G. M., Bell, J. A. & Lilburn, T. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 2. (eds. Brenner, D. J., Krieg, N. R. & Staley, J. T.) 159-220 (Springer-Verlag, New York, 2005).
• Geissinger, O., Herlemann, D. P. R., Mörschel, E., Maier, U. G. & Brune, A. The ultramicrobacterium “Elusimicrobium minutum” gen. nov., sp. nov., the first cultivated representative of the Termite Group 1 phylum. Appl. Environ. Microbiol. 75, 2831-2840 (2009).
• Hoffmann, L., Komárek, J. & Kaštovský, J. System of cyanoprokaryotes (cyanobacteria) - state in 2004. Arch. Hydrobiol. Suppl. Algol. Stud. 117, 95-115 (2005).
• Hugenholtz, P. & Stackebrandt, E. Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended description). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54, 2049-2051 (2004).
• Iino, T. et al. Ignavibacterium album gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic anaerobic bacterium isolated from microbial mats at a terrestrial hot spring and proposal of Ignavibacteria classis nov., for a novel lineage at the periphery of green sulfur bacteria. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60, 1376-1382 (2010).
• Im, W.-T. et al. Description of Fimbriimonas ginsengisoli gen. nov., sp. nov. within the Fimbriimonadia class nov., of the phylum Armatimonadetes. Antonie van Leeuwenhoek 102, 307-317 (2012).
• Jumas-Bilak, E., Roudière, L. & Marchandin, H. Description of ‘Synergistetes’ phyl. nov. and emended description of the phylum ‘Deferribacteres’ and of the family Syntrophomonadaceae, phylum ‘Firmicutes’. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 1028-1035 (2009).
• Kurahashi, M., Fukunaga, Y., Harayama, S. & Yokota, A. Sneathiella glossodoripedis sp. nov., a marine alphaproteobacterium isolated from the nudibranch Glossodoris cincta, and proposal of Sneathiellales ord. nov. and Sneathiellaceae fam. nov. Int. J. *Syst. Evol. Microbiol. 58, 548-552 (2008).
• Kurahashi, M., Fukunaga, Y., Sakiyama, Y., Harayama, S. & Yokota, A. Euzebya tangerina gen. nov., sp. nov., a deeply branching marine actinobacterium isolated from the sea cucumber Holothuria edulis, and proposal of Euzebyaceae fam. nov., Euzebyales *ord. nov. and Nitriliruptoridae subclassis nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60, 2314-2319 (2010).
• Lee, K. C.-Y. et al. Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., an aerobic, pigmented, thermophilic micro-organism of a novel bacterial class, Chthonomonadetes classis nov., of the newly described phylum Armatimonadetes originally designated *candidate division OP10. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 2482-2490 (2011).
• Ludwig, W., Schleifer, K.-H. & Whitman, W. B. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 3, The Firmicutes (eds. De Vos, P. et al.) 15-17 (Springer, Dordrecht, 2009).
• Ludwig, W., Euzéby, J. & Whitman, W. B. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 4, The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, *Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes (eds. Krieg, N. R. et al.) 1-19 (Springer, New York, 2011).
• Ludwig, W. et al. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 5, The Actinobacteria, Part A (eds. Goodfellow, M. et al.) 1-31 (Springer, New York, 2012).
• Marchandin, H. et al. Negativicoccus succinicivorans gen. nov., sp. nov., isolated from human clinical samples, emended description of the family Veillonellaceae and description of Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. nov. and *Acidaminococcaceae fam. nov. in the bacterial phylum Firmicutes. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60, 1271-1279 (2010).
• Margulis, L. & Schwartz, K. V. Five Kingdoms: an Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth. 3rd ed. (Henry Holt and Company, New York, 1998).
• Marin, B., Nowack, E. C. M. & Melkonian, M. A plastid in the making: Evidence for a second primary endosymbiosis. Protist 156, 425-432 (2005).
• Mesbah, N. M., Hedrick, D. B., Peacock, A. D., Rohde, M. & Wiegel, J. Natranaerobius thermophilus gen. nov., sp. nov., a halophilic, alkalithermophilic bacterium from soda lakes of the Wadi An Natrun, Egypt, and proposal of Natranaerobiaceae fam. nov. *and Natranaerobiales ord. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57, 2507-2512 (2007).
• Miroshnichenko, M. L. et al. Caminibacter profundus sp. nov., a novel thermophile of Nautiliales ord. nov. within the class 'Epsilonproteobacteria', isolated from a deep-sea hydrothermal vent. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54, 41-45 (2004).
• Mori, K., Yamaguchi, K., Sakiyama, Y., Urabe, T. & Suzuki, K. Caldisericum exile gen. nov., sp. nov., an anaerobic, thermophilic, filamentous bacterium of a novel bacterial phylum, Caldiserica phyl. nov., originally called the candidate phylum OP5, and description of Caldisericaceae fam. nov., Caldisericales ord. nov. and Caldisericia classis nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 2894-2898 (2009).
• Murray, R. G. E. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Vol. 1. (eds. Krieg, N. R. & Holt, J. G.) 31-34 (Williams and Wilkins, Baltimore, 1984).
• Reddy, G. S. N. & Garcia-Pichel, F. Description of Patulibacter americanus sp. nov., isolated from biological soil crusts, emended description of the genus Patulibacter Takahashi et al. 2006 and proposal of Solirubrobacterales ord. nov. and *Thermoleophilales ord. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 87-94 (2009).
• Schleifer, K.-H. in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edn, Vol. 3, The Firmicutes (eds. De Vos, P. et al.) 19 (Springer, Dordrecht, 2009).
• Sokolova, T. et al. Novel chemolithotrophic, thermophilic, anaerobic bacteria Thermolithobacter ferrireducens gen. nov., sp. nov. and Thermolithobacter carboxydivorans sp. nov. Extremophiles 11, 145-157 (2007).
• Sorokin, D. Y., van Pelt, S., Tourova, T. P. & Evtushenko, L. I. Nitriliruptor alkaliphilus gen. nov., sp. nov., a deep-lineage haloalkaliphilic actinobacterium from soda lakes capable of growth on aliphatic nitriles, and proposal of Nitriliruptoraceae fam. nov. and Nitriliruptorales ord. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 248-253 (2009).
• Tamaki, H. et al. Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 1442-1447 (2011).
• Wiese, J., Thiel, V., Gärtner, A., Schmaljohann, R. & Imhoff, J. F. Kiloniella laminariae gen. nov., sp. nov., an alphaproteobacterium from the marine macroalga Laminaria saccharina. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 350-356 (2009).
• Yabe, S., Aiba, Y., Sakai, Y., Hazaka, M. & Yokota, A. Thermosporothrix hazakensis gen. nov., sp. nov., isolated from compost, description of Thermosporotrichaceae fam. nov. within the class Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 and emended description of the class Ktedonobacteria. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60, 1794-1801 (2010).
• Yabe, S., Aiba, Y., Sakai, Y., Hazaka, M. & Yokota, A. Thermogemmatispora onikobensis gen. nov., sp. nov. and Thermogemmatispora foliorum sp. nov., isolated from fallen leaves on geothermal soils, and description of Thermogemmatisporaceae fam. nov. and Thermogemmatisporales ord. nov. within the class Ktedonobacteria. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 903-910 (2011).
• Yamada, T. et al. Anaerolinea thermolimosa sp. nov., Levilinea saccharolytica gen. nov., sp. nov. and Leptolinea tardivitalis gen. nov., sp. nov., novel filamentous anaerobes, and description of the new classes Anaerolineae classis nov. and Caldilineae classis nov. in the bacterial phylum Chloroflexi. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56, 1331-1340 (2006).