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「ハプログループC2 (Y染色体)」の版間の差分

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'''ハプログループC-M217 (Y染色体)'''（ハプログループC-M217 Yせんしょくたい、英: Haplogroup C-M217 (Y-DNA)）、系統名称'''ハプログループC2'''とは[[分子人類学]]において人類の父系を示す[[Y染色体ハプログループ]]（型集団）の分類で、[[ハプログループC (Y染色体)|ハプログループC]]の下位枝に属し、「M217, P44, PK2」によって定義されるグループである。かつては'''ハプログループC3'''と呼ばれていた。
'''ハプログループC-M217 (Y染色体)'''（ハプログループC-M217 Yせんしょくたい、英: Haplogroup C-M217 (Y-DNA)）、系統名称'''ハプログループC2'''とは[[分子人類学]]において人類の父系を示す[[Y染色体ハプログループ]]（型集団）の分類で、[[ハプログループC (Y染色体)|ハプログループC]]の下位枝に属し、「M217, P44, PK2」によって定義されるグループである。かつては'''ハプログループC3'''と呼ばれていた。
約50,865年前<ref name = "Karmin2015" /><!-- <ref name="Zhong">Zhong et al, Global Distribution of Y-Chromosome Haplogroup C Reveals the Prehistoric Migration Routes of African Exodus and Early Settlement in East Asia. (abstract) Journal of Human Genetics, 55(7):428-35, 2010. </ref> -->にC1-F3393/Z1426と共通の祖先から派生して、現存の全てのC-M217の[[最も近い共通祖先]]は約35,383年前<ref name = "Karmin2015" />にユーラシア大陸北東部で生まれたと考えられる。民族の総人口に占める割合としては、ユーラシアでは[[ツングース系民族]]、[[モンゴル系民族]]、[[カザフ]]、[[ハザーラ人|ハザーラ]]、[[コリャーク]]、[[イテリメン]]、[[ユカギール人|ユカギール]]、[[ニヴフ]]に多く見られ、アメリカ大陸では[[ナデネ語族]]話者に比較的多く見られる。日本人には3%乃至6%ほど観察されている<ref name="Hammer 2006">Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. ,{{doi|10.1007/s10038-005-0322-0}}. PMID 16328082. </ref><ref name="Nonaka2007">I. Nonaka, K. Minaguchi, and N. Takezaki, "Y-chromosomal Binary Haplogroups in the Japanese Population and their Relationship to 16 Y-STR Polymorphisms," Annals of Human Genetics (2007) 71,480–495. {{doi|10.1111/j.1469-1809.2006.00343}}.</ref><ref name="Sato2014">YOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI [https://doi.org/10.1537/ase.140709 Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males.] Anthropological Science. 2014 Volume 122, Issue 3, Pages 131-136, {{doi|10.1537/ase.140709}}</ref><ref name="Poznik2016">G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, ''et al.'', "Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences." ''Nature Genetics'' (2016) ,{{doi|10.1038/ng.3559}}.</ref>。
約50,865年前<ref name = "Karmin2015" /><!-- <ref name="Zhong">Zhong et al, Global Distribution of Y-Chromosome Haplogroup C Reveals the Prehistoric Migration Routes of African Exodus and Early Settlement in East Asia. (abstract) Journal of Human Genetics, 55(7):428-35, 2010. </ref> -->にC1-F3393/Z1426と共通の祖先から派生して、現存の全てのC-M217の[[最も近い共通祖先]]は約35,383年前<ref name = "Karmin2015" />にユーラシア大陸北東部で生まれたと考えられる。民族の総人口に占める割合としては、ユーラシアでは[[ツングース系民族]]、[[モンゴル系民族]]、[[カザフ人|カザフ]]、[[ハザーラ人|ハザーラ]]、[[コリャーク]]、[[イテリメン]]、[[ユカギール人|ユカギール]]、[[ニヴフ]]に多く見られ、アメリカ大陸では[[ナデネ語族]]話者に比較的多く見られる。日本人には3%乃至6%ほど観察されている<ref name="Hammer 2006">Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. ,{{doi|10.1007/s10038-005-0322-0}}. PMID 16328082. </ref><ref name="Nonaka2007">I. Nonaka, K. Minaguchi, and N. Takezaki, "Y-chromosomal Binary Haplogroups in the Japanese Population and their Relationship to 16 Y-STR Polymorphisms," Annals of Human Genetics (2007) 71,480–495. {{doi|10.1111/j.1469-1809.2006.00343}}.</ref><ref name="Sato2014">YOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI [https://doi.org/10.1537/ase.140709 Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males.] Anthropological Science. 2014 Volume 122, Issue 3, Pages 131-136, {{doi|10.1537/ase.140709}}</ref><ref name="Poznik2016">G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, ''et al.'', "Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences." ''Nature Genetics'' (2016) ,{{doi|10.1038/ng.3559}}.</ref>。


==各民族の頻度==
==各民族の頻度==
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********C-Y13856
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*********C-Y13856*
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*********C-M407 [[ブリヤート共和国]]のブリヤート族、ソヨト族、ハムニガン族に高頻度、[[カルムイク人|カルムイク族]]およびその他の[[モンゴル民族]]に中頻度、[[ペー族]], [[カンボジア人]], [[漢民族]], [[日本人]], [[朝鮮民族]],<ref name="Park2013">{{cite journal | last1 = Park | first1 = Jin | last2 = Lee | first2 = Young | last3 = Kim | first3 = Young | last4 = -1#Myung | first4 = Hwan Na et al. | year = 2013 | title = Y-SNP miniplexes for East Asian Y-chromosomal haplogroup determination in degraded DNA | url = | journal = Forensic Science International: Genetics | volume = 7 | issue = | pages = 75–81 | doi=10.1016/j.fsigen.2012.06.014}}</ref> [[満州族]], [[トゥチャ族]], [[ウイグル人]], [[カザフ]]人、[[トゥバ人]], [[アルタイ人|テレウト族]], [[エヴェンキ]], [[ヤクート人]]、[[アルメニア人]]等に低頻度にみられる。''<ref name="Sengupta2006"/><ref name="HuaZhong2010">{{cite journal | last1=Zhong | first1=Hua | last2=Shi | first2=Hong | last3=Xue- | first3= XB| last4=Qi | first4=Bin | last5=Jin | year=2010 | first5=L | last6=Ma | first6=RZ | last7=Su | first7=B | title=Global distribution of Y-chromosome haplogroup C reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia | url=| journal=Journal of Human Genetics | volume= 55| issue=7| pages= 428–35| pmid=20448651 | doi=10.1038/jhg.2010.40 }}</ref>
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**********C-F3850 [[ブリヤート共和国]]（[[ブリヤート人]]）、インドネシア（[[華人]]）、漢族（[[山東省]]）、日本（東京）
**********C-F3850 [[ブリヤート共和国]]（[[ブリヤート人]]）、インドネシア（[[華人]]）、漢族（[[山東省]]）、日本（東京）
**********C-F3753 漢族（[[吉林省]]）、[[ウイグル人]]
**********C-F3753 漢族（[[吉林省]]）、[[ウイグル人]]
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ハプログループC2は[[アルタイ諸語]]と[[古アジア諸語]]、[[ナデネ語族]]話者に高頻度である。[[デネ]]（ナデネ語族話者）に多いのはC-P39であるが、[[ハプログループQ (Y染色体)]]がそれ以上に高頻度であり、[[デネ・エニセイ語族]]仮説があることから、言語系統を反映しているのは[[ケット人]]にも高頻度のハプログループQと考えられる。いっぽう古アジア諸語の担い手はC-M48であり、その下位系統の一部がアルタイ諸語と強い相関を示すことから、アルタイ諸語の基層には[[ニブフ語]]のような古アジア諸語が想定できるかもしれない。
ハプログループC2は[[アルタイ諸語]]と[[古アジア諸語]]、[[ナデネ語族]]話者に高頻度である。[[デネ]]（ナデネ語族話者）に多いのはC-P39であるが、[[ハプログループQ (Y染色体)]]がそれ以上に高頻度であり、[[デネ・エニセイ語族]]仮説があることから、言語系統を反映しているのは[[ケット人]]にも高頻度のハプログループQと考えられる。いっぽう古アジア諸語の担い手はC-M48であり、その下位系統の一部がアルタイ諸語と強い相関を示すことから、アルタイ諸語の基層には[[ニブフ語]]のような古アジア諸語が想定できるかもしれない。


なおアルタイ系民族（[[チュルク系民族]]、[[モンゴル系民族]]、[[ツングース系民族]]）で高頻度なC2の多くはC-M48やC-P39を含むC-L1373系統であるが、逆に朝鮮民族や漢民族、日本人など東アジアの民族ではC-F1067系統が大半で、C-L1373はわずかである<ref name="Kwon2015">So Yeun Kwon, Hwan Young Lee, Eun Young Lee, Woo Ick Yang, and Kyoung-Jin Shin, "Confirmation of Y haplogroup tree topologies with newly suggested Y-SNPs for the C2, O2b and O3a subhaplogroups." ''Forensic Science International: Genetics'' 19 (2015) 42–46. {{doi|10.1016/j.fsigen.2015.06.003}}</ref>。しかし、バイカル湖周辺のブリヤート共和国に居住するブリヤート、ソヨト、ハムニガン（エヴェンキ）諸先住民族及び[[カザフ]]の[[コンギラト]]部（コヌラト部）に多いC-M407は東アジアに多いC-F1067系統に属している。<ref name="Malyarchuk2010">Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova, Marcin Wozniak, Tomasz Grzybowski, Irina Dambueva, and Ilia Zakharov, "Phylogeography of the Y-chromosome haplogroup C in northern Eurasia." ''Annals of Human Genetics'' (2010) 74, 539–546. {{doi| 10.1111/j.1469-1809.2010.00601.x}}</ref><ref name="Yan2014">Yan S, Wang C-C, Zheng H-X, Wang W, Qin Z-D, et al. (2014) "Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers." ''PLoS ONE'' 9(8): e105691. {{doi|10.1371/journal.pone.0105691}}</ref> C-L1373とC-F1067はおおよそ34,400年<ref name="YFull">[http://www.yfull.com/tree/C-M217/ YFull Haplogroup C-M217 YTree] v5.07 at 05 November 2017</ref>もしくは35,383 [95% CI 33,305 <-> 37,537]年<ref name = "Karmin2015" />前に男系直系祖先の血筋が分かれたと推定されている。なお、朝鮮語の担い手としてC-F1067系統が想定できるかもしれない。
なおアルタイ系民族（[[チュルク系民族]]、[[モンゴル系民族]]、[[ツングース系民族]]）で高頻度なC2の多くはC-M48やC-P39を含むC-L1373系統であるが、逆に朝鮮民族や漢民族、日本人など東アジアの民族ではC-F1067系統が大半で、C-L1373はわずかである<ref name="Kwon2015">So Yeun Kwon, Hwan Young Lee, Eun Young Lee, Woo Ick Yang, and Kyoung-Jin Shin, "Confirmation of Y haplogroup tree topologies with newly suggested Y-SNPs for the C2, O2b and O3a subhaplogroups." ''Forensic Science International: Genetics'' 19 (2015) 42–46. {{doi|10.1016/j.fsigen.2015.06.003}}</ref>。しかし、バイカル湖周辺のブリヤート共和国に居住するブリヤート、ソヨト、ハムニガン（エヴェンキ）諸先住民族及び[[カザフ人|カザフ]]の[[コンギラト]]部（コヌラト部）に多いC-M407は東アジアに多いC-F1067系統に属している。<ref name="Malyarchuk2010">Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova, Marcin Wozniak, Tomasz Grzybowski, Irina Dambueva, and Ilia Zakharov, "Phylogeography of the Y-chromosome haplogroup C in northern Eurasia." ''Annals of Human Genetics'' (2010) 74, 539–546. {{doi| 10.1111/j.1469-1809.2010.00601.x}}</ref><ref name="Yan2014">Yan S, Wang C-C, Zheng H-X, Wang W, Qin Z-D, et al. (2014) "Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers." ''PLoS ONE'' 9(8): e105691. {{doi|10.1371/journal.pone.0105691}}</ref> C-L1373とC-F1067はおおよそ34,400年<ref name="YFull">[http://www.yfull.com/tree/C-M217/ YFull Haplogroup C-M217 YTree] v5.07 at 05 November 2017</ref>もしくは35,383 [95% CI 33,305 <-> 37,537]年<ref name = "Karmin2015" />前に男系直系祖先の血筋が分かれたと推定されている。なお、朝鮮語の担い手としてC-F1067系統が想定できるかもしれない。


世界諸民族に於ける遺伝子の分布を比較する分子集団遺伝学的研究などによく利用される[[1000人ゲノムプロジェクト]]の日本人サンプル（JPT, "Japanese in Tokyo, Japan"）56人のうち、2人がC-M217に属しているという結果が2016年の論文で報告されている。<ref name="Poznik2016" /> さらに、2人がC-F1067のサブクレードに当たるC-F3850とC-F5477/SK1036(xC-F13762)にそれぞれ分類されている。<ref name="YFull" />
世界諸民族に於ける遺伝子の分布を比較する分子集団遺伝学的研究などによく利用される[[1000人ゲノムプロジェクト]]の日本人サンプル（JPT, "Japanese in Tokyo, Japan"）56人のうち、2人がC-M217に属しているという結果が2016年の論文で報告されている。<ref name="Poznik2016" /> さらに、2人がC-F1067のサブクレードに当たるC-F3850とC-F5477/SK1036(xC-F13762)にそれぞれ分類されている。<ref name="YFull" />

2021年6月28日 (月) 21:37時点における版

C2 (Y染色体) 系統
ハプログループC2の分布図
系統祖 {{{major-haplo}}}
発生時期 50,865 [95% CI 49,191 <-> 52,699]年前[1]
発生地（推定） 中央アジアまたはシベリアまたは東アジア北部（アルタイ山脈〜モンゴル高原付近）
現存下位系統の
分岐開始年代（下限値）		 35,383 [95% CI 33,305 <-> 37,537]年前[1]
親階層 C
分岐指標 M217, P44, PK2
子階層 C2a-L1373, C2b-F1067
高頻度民族・地域 北東アジア、中央アジア(カザフスタン)、北アメリカ北西部。
カザフ人、モンゴル系民族、ツングース系民族、古アジア系民族、ナデネ系民族に高頻度。

ハプログループC-M217 (Y染色体)（ハプログループC-M217 Yせんしょくたい、英: Haplogroup C-M217 (Y-DNA)）、系統名称ハプログループC2とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ（型集団）の分類で、ハプログループCの下位枝に属し、「M217, P44, PK2」によって定義されるグループである。かつてはハプログループC3と呼ばれていた。 約50,865年前[1]にC1-F3393/Z1426と共通の祖先から派生して、現存の全てのC-M217の最も近い共通祖先は約35,383年前[1]にユーラシア大陸北東部で生まれたと考えられる。民族の総人口に占める割合としては、ユーラシアではツングース系民族、モンゴル系民族、カザフ、ハザーラ、コリャーク、イテリメン、ユカギール、ニヴフに多く見られ、アメリカ大陸ではナデネ語族話者に比較的多く見られる。日本人には3%乃至6%ほど観察されている[2][3][4][5]。

各民族の頻度

ハプログループCの拡散経路

下位区分

（系統樹、系統名称はY-DNA Haplogroup C and its Subclades - 2019による。）

言語・民族との関連

ハプログループC2はアルタイ諸語と古アジア諸語、ナデネ語族話者に高頻度である。デネ（ナデネ語族話者）に多いのはC-P39であるが、ハプログループQ (Y染色体)がそれ以上に高頻度であり、デネ・エニセイ語族仮説があることから、言語系統を反映しているのはケット人にも高頻度のハプログループQと考えられる。いっぽう古アジア諸語の担い手はC-M48であり、その下位系統の一部がアルタイ諸語と強い相関を示すことから、アルタイ諸語の基層にはニブフ語のような古アジア諸語が想定できるかもしれない。

なおアルタイ系民族（チュルク系民族、モンゴル系民族、ツングース系民族）で高頻度なC2の多くはC-M48やC-P39を含むC-L1373系統であるが、逆に朝鮮民族や漢民族、日本人など東アジアの民族ではC-F1067系統が大半で、C-L1373はわずかである[25]。しかし、バイカル湖周辺のブリヤート共和国に居住するブリヤート、ソヨト、ハムニガン（エヴェンキ）諸先住民族及びカザフのコンギラト部（コヌラト部）に多いC-M407は東アジアに多いC-F1067系統に属している。[29][30] C-L1373とC-F1067はおおよそ34,400年[31]もしくは35,383 [95% CI 33,305 <-> 37,537]年[1]前に男系直系祖先の血筋が分かれたと推定されている。なお、朝鮮語の担い手としてC-F1067系統が想定できるかもしれない。

世界諸民族に於ける遺伝子の分布を比較する分子集団遺伝学的研究などによく利用される1000人ゲノムプロジェクトの日本人サンプル（JPT, "Japanese in Tokyo, Japan"）56人のうち、2人がC-M217に属しているという結果が2016年の論文で報告されている。[5] さらに、2人がC-F1067のサブクレードに当たるC-F3850とC-F5477/SK1036(xC-F13762)にそれぞれ分類されている。[31]

Sun et al (2020) は、北アメリカ先住民にも見られるC2a-L1373が最終氷期後の17,700-14,300年前に拡散を開始したと算出しており、アメリカ先住民が25,000年前にベーリンジアにいた集団に由来するとする説に異論を唱えている[32]。

関連項目

ヒトのY染色体ハプログループの系統樹
Y染色体アダム (Y-MRCA)
A0 A1
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J K1 K2
L T MS NO P K2*
N O Q R

脚注

  1. ^ a b c d e Monika Karmin, Lauri Saag, Mário Vicente, et al. (2015), "A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture." Genome Research 25:1–8. Published by Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISSN 1088-9051/15; http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.186684.114.
  2. ^ a b c d e Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. ,doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  3. ^ a b I. Nonaka, K. Minaguchi, and N. Takezaki, "Y-chromosomal Binary Haplogroups in the Japanese Population and their Relationship to 16 Y-STR Polymorphisms," Annals of Human Genetics (2007) 71,480–495. doi:10.1111/j.1469-1809.2006.00343.
  4. ^ a b YOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males. Anthropological Science. 2014 Volume 122, Issue 3, Pages 131-136, doi:10.1537/ase.140709
  5. ^ a b G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, et al., "Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences." Nature Genetics (2016) ,doi:10.1038/ng.3559.
  6. ^ a b c d e f g h i Xue Y, Zerjal T, Bao W et al. (April 2006). "Male demography in East Asia: a north-south contrast in human population expansion times". Genetics 172 (4): 2431–9. doi:10.1534/genetics.105.054270. PMC 1456369. PMID 16489223.
  7. ^ a b c d e f g h i j k Karafet T, Xu L, Du R et al. (September 2001). "Paternal population history of East Asia: sources, patterns, and microevolutionary processes". Am. J. Hum. Genet. 69 (3): 615–28. doi:10.1086/323299. PMC 1235490. PMID 11481588.
  8. ^ a b c d Pakendorf B, Novgorodov IN, Osakovskij VL, Stoneking M (July 2007). "Mating patterns amongst Siberian reindeer herders: inferences from mtDNA and Y-chromosomal analyses". Am. J. Phys. Anthropol. 133 (3): 1013–27. doi:10.1002/ajpa.20590. PMID 17492671.
  9. ^ a b Tatiana M. Karafet, Ludmila P. Osipova, Marina A. Gubina et al., High Levels of Y-Chromosome Differentiation among Native Siberian Populations and the Genetic Signature of a Boreal Hunter-Gatherer Way of Life, Human Biology, December 2002, v. 74, no. 6, pp. 761–789.
  10. ^ E. V. Balanovska, Y. V. Bogunov, E. N. Kamenshikova, et al., "Demographic and Genetic Portraits of the Ulchi Population." ISSN 1022-7954, Russian Journal of Genetics, 2018, Vol. 54, No. 10, pp. 1245–1253. doi:10.1134/S1022795418100046
  11. ^ a b c Tajima, Atsushi; Hayami, Masanori; Tokunaga, Katsushi; Juji, T; Matsuo, M; Marzuki, S; Omoto, K; Horai, S (2004). "Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages". Journal of Human Genetics 49 (4): 187–193. doi:10.1007/s10038-004-0131-x. PMID 14997363.
  12. ^ Wells, Spencer et al. 2001, The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity
  13. ^ a b c d Zegura SL, Karafet TM, Zhivotovsky LA, Hammer MF (January 2004). "High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas". Mol. Biol. Evol. 21 (1): 164–75. doi:10.1093/molbev/msh009. PMID 14595095.
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