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高源寺(こうげんじ)は日本の寺の名称。
- 高源寺 (丹波市) - 兵庫県丹波市、臨済宗妙心寺派。
- 高源寺 - 静岡県静岡市清水区、臨済宗妙心寺派、十一面観世音菩薩。
- 高源寺 - 静岡県田方郡函南町、創建当時は真言宗、現在は曹洞宗。
- 高源寺 - 滋賀県犬上郡多賀町、臨済宗妙心寺派、阿弥陀如来。
- 高源寺 - 茨城県取手市下高井、臨済宗妙心寺派。
- 高源寺 (行田市) - 埼玉県行田市、臨済宗円覚寺派。
- 高源寺 - 群馬県邑楽郡邑楽町・旧狸塚()。
- 高源寺 - 群馬県藤岡市、曹洞宗、釈迦如来。
- 高源寺 - 群馬県高崎市。
- 高源寺 - 山形県山形市今塚、曹洞宗。
- 高源寺 - 大分県竹田市。