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DNMT3L

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
DNMT3L
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2PV0, 2PVC, 2QRV, 4U7P, 4U7T

識別子
記号DNMT3L, DNA methyltransferase 3 like
外部IDOMIM: 606588 MGI: 1859287 HomoloGene: 8362 GeneCards: DNMT3L
遺伝子の位置 (ヒト)
21番染色体 (ヒト)
染色体21番染色体 (ヒト)[1]
21番染色体 (ヒト)
DNMT3L遺伝子の位置
DNMT3L遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点44,246,339 bp[1]
終点44,262,216 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
10番染色体 (マウス)
染色体10番染色体 (マウス)[2]
10番染色体 (マウス)
DNMT3L遺伝子の位置
DNMT3L遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点77,877,781 bp[2]
終点77,899,456 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 酵素結合
酵素調節活性
enzyme activator activity
血漿タンパク結合
金属イオン結合
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞の構成要素 細胞質基質
細胞核
ESC/E(Z) complex
生物学的プロセス regulation of gene expression by genetic imprinting
DNAメチル化
触媒活性調節
negative regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of catalytic activity
male meiosis I
精子形成
細胞分化
DNA methylation on cytosine
DNA methylation involved in gamete generation
stem cell differentiation
negative regulation of DNA methylation
positive regulation of DNA methylation
regulation of transcription by RNA polymerase II
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_013369
NM_175867

NM_001081695
NM_001284197
NM_001284198
NM_001284199
NM_001284200

NM_019448

RefSeq
(タンパク質)

NP_037501
NP_787063

NP_001075164
NP_001271126
NP_001271127
NP_001271128
NP_001271129

NP_062321

場所
(UCSC)
Chr 21: 44.25 – 44.26 MbChr 21: 77.88 – 77.9 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

DNMT3L(DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like)は、ヒトではDNMT3L遺伝子によってコードされるタンパク質である[5][6]

機能

[編集]

CpG英語版メチル化は、胚発生インプリンティングX染色体の不活性化に重要なエピジェネティック修飾である。マウスでの研究では、DNAのメチル化は哺乳類の発生に必要であることが実証されている。DNMT3L遺伝子は、DNAメチルトランスフェラーゼに類似した核内タンパク質をコードする。このDNMT3Lタンパク質はメチルトランスフェラーゼ活性に必要なアミノ酸残基を持たないため、DNAメチルトランスフェラーゼとしては機能しないと考えられている。しかしながら、このタンパク質はDNMT3Aによるde novoメチル化を促進し、母親由来のゲノムインプリンティングの確立に必要であると考えられている。また、このタンパク質はHDAC1英語版との相互作用を介して転写抑制を媒介する。この遺伝子からは選択的スプライシングによって、2種類の転写バリアントが生じる。他のスプライシングバリアントも記載されているが、その生物学的妥当性は明らかではない[6]

相互作用

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DNMT3LはHDAC1英語版と相互作用することが示されている[7][8]

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142182 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000730 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Isolation and initial characterization of a novel zinc finger gene, DNMT3L, on 21q22.3, related to the cytosine-5-methyltransferase 3 gene family”. Genomics 65 (3): 293–8. (August 2000). doi:10.1006/geno.2000.6168. PMID 10857753. 
  6. ^ a b Entrez Gene: DNMT3L DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like”. 2021年8月7日閲覧。
  7. ^ “Imprinting regulator DNMT3L is a transcriptional repressor associated with histone deacetylase activity”. Nucleic Acids Res. 30 (16): 3602–8. (2002). doi:10.1093/nar/gkf474. PMC 134241. PMID 12177302. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC134241/. 
  8. ^ “Dnmt3L is a transcriptional repressor that recruits histone deacetylase”. Nucleic Acids Res. 30 (17): 3831–8. (September 2002). doi:10.1093/nar/gkf509. PMC 137431. PMID 12202768. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC137431/. 

関連文献

[編集]