NAMD
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開発元 | Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) and the Parallel Programming Laboratory (PPL) |
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最新版 |
2.14
/ 2020年8月 |
リポジトリ | |
対応OS | クロスプラットフォーム |
対応言語 | C++ |
ライセンス | プロプライエタリソフトウェア |
公式サイト | ks.uiuc.edu/Research/namd |
NAMD (NAnoscale Molecular Dynamics program)[1]は、フリーウェアの分子動力学シミュレーションパッケージの一つである。Charm++並列プログラミングモデルを用いて書かれ、並列効率の高さで知られており、大規模な系(数百万の原子)をシミュレートするためにしばしば使われている[2]。NAMDはイリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のTheoretical and Computational Biophysics Group (TCB) とParallel Programming Laboratory (PPL) との共同研究によって開発されている。
NAMDは1995年にNelsonらによって、可視化コードであるVMDとの連携によってインタラクティブなシミュレーションを可能にする並列分子動力学コードとして導入された。NAMDは、多くの機能を追加し、数千のプロセッサにスケーリングされ、成熟している。2020年8月現在の最新安定版は2.14である。
非商用利用する個人、学術機関、社内ビジネス目的の企業は、コンパイル済みのバイナリとソースコードの両方が無償で入手可能である。