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RBBP4

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
RBBP4
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2XU7, 3GFC, 4PBY, 4PBZ, 4PC0, 4R7A, 5FXY

識別子
記号RBBP4, NURF55, RBAP48, lin-53, retinoblastoma binding protein 4, RB binding protein 4, chromatin remodeling factor
外部IDOMIM: 602923 MGI: 1194912 HomoloGene: 21153 GeneCards: RBBP4
遺伝子の位置 (ヒト)
1番染色体 (ヒト)
染色体1番染色体 (ヒト)[1]
1番染色体 (ヒト)
RBBP4遺伝子の位置
RBBP4遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点32,651,142 bp[1]
終点32,686,211 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
4番染色体 (マウス)
染色体4番染色体 (マウス)[2]
4番染色体 (マウス)
RBBP4遺伝子の位置
RBBP4遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点129,200,893 bp[2]
終点129,229,163 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
ATP-dependent activity, acting on DNA
histone binding
ヒストンデアセチラーゼ結合
血漿タンパク結合
nucleosomal DNA binding
histone deacetylase activity
細胞の構成要素 Mi-2/NuRD複合体
ESC/E(Z) complex
CAF-1 complex
Sin3 complex
核質
NURF complex
細胞核
細胞質基質
高分子複合体
生物学的プロセス クロマチンリモデリング
regulation of transcription, DNA-templated
CENP-A containing chromatin assembly
transcription, DNA-templated
regulation of cell cycle
DNA replication-dependent chromatin assembly
DNA複製
negative regulation of gene expression, epigenetic
細胞周期
negative regulation of cell population proliferation
regulation of signal transduction by p53 class mediator
histone deacetylation
response to growth hormone
negative regulation of G0 to G1 transition
chromatin organization
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_005610
NM_001135255
NM_001135256

NM_009030

RefSeq
(タンパク質)

NP_001128727
NP_001128728
NP_005601

NP_033056

場所
(UCSC)
Chr 1: 32.65 – 32.69 MbChr 1: 129.2 – 129.23 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

RBBP4(retinoblastoma binding protein 4)は、ヒトではRBBP4遺伝子によってコードされるタンパク質である[5][6]RbAp48(retinoblastoma-associated protein 48)、NURF55(nucleosome remodeling factor 55)といった名称でも知られる。

機能

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RBBP4はWDリピートタンパク質ファミリーに属し、普遍的に発現している核内タンパク質であり、ヒストンアセチル化クロマチンの組み立てに関与するタンパク質複合体中に存在する。RBBP4はMi-2/NuRD複合体英語版の一部を構成しており、この複合体はクロマチンリモデリングやヒストンの脱アセチル化と関連した転写抑制への関与が示唆されている。またこのタンパク質は、転写サイレンシングの重要な要素であるコリプレッサー複合体の一部にもなっている。Rbタンパク質と直接相互作用して細胞増殖を調節するタンパク質の1つであることも知られており、E2F応答性遺伝子の転写抑制にも関与しているようである[7]

臨床的意義

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脳内の海馬歯状回英語版におけるRBBP4の減少は、正常な老化過程における記憶の低下の主要因である可能性がある[8]。ヒトの剖検組織、そしてマウスでも、歯状回において加齢と関連したRBBP4の減少が観察される。さらに、ドミナントネガティブ型遺伝子のノックインによって、若齢マウスでも老齢マウスで観察されるような記憶の欠陥が引き起こされる。レンチウイルスを用いた遺伝子導入によって脳内でのRBBP4の発現を高めることで、老齢マウスの記憶の欠陥は回復する[8]

RBBP4の作用の少なくとも一部は、PKA-CREB1英語版-CBP英語版経路を介したものである[8]。したがって、この経路を刺激する薬剤は、加齢と関連した記憶の低下を回復するための治療アプローチの1つとなる可能性がある。アデニル酸シクラーゼと正に共役しているD1/D5ドーパミン受容体に対するアゴニストである6-Br-APB英語版SKF-38,393英語版cAMPホスホジエステラーゼ英語版阻害薬であるロリプラムは老齢マウスの記憶の欠陥を低減することが示されている[9]

相互作用

[編集]

RBBP4は次に挙げる因子と荘祖作用することが示されている。

出典

[編集]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162521 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057236 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “A retinoblastoma-binding protein related to a negative regulator of Ras in yeast”. Nature 364 (6438): 648–52. (September 1993). Bibcode1993Natur.364..648Q. doi:10.1038/364648a0. PMID 8350924. 
  6. ^ “Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression”. EMBO J 22 (22): 6089–100. (November 2003). doi:10.1093/emboj/cdg582. PMC 275440. PMID 14609955. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC275440/. 
  7. ^ Entrez Gene: RBBP4 retinoblastoma-binding protein 4”. 2024年11月30日閲覧。
  8. ^ a b c “Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein RbAp48”. Sci Transl Med 5 (200): 200ra115. (August 2013). doi:10.1126/scitranslmed.3006373. PMC 4940031. PMID 23986399. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4940031/. 
  9. ^ “Age-related defects in spatial memory are correlated with defects in the late phase of hippocampal long-term potentiation in vitro and are attenuated by drugs that enhance the cAMP signaling pathway”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (9): 5280–5. (April 1999). Bibcode1999PNAS...96.5280B. doi:10.1073/pnas.96.9.5280. PMC 21855. PMID 10220457. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC21855/. 
  10. ^ “BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (9): 4983–8. (1999). Bibcode1999PNAS...96.4983Y. doi:10.1073/pnas.96.9.4983. PMC 21803. PMID 10220405. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC21803/. 
  11. ^ “Histone binding protein RbAp48 interacts with a complex of CREB binding protein and phosphorylated CREB”. Mol. Cell. Biol. 20 (14): 4970–8. (2000). doi:10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000. PMC 85947. PMID 10866654. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC85947/. 
  12. ^ “Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex”. Mol. Cell. Biol. 22 (2): 536–46. (2002). doi:10.1128/MCB.22.2.536-546.2002. PMC 139742. PMID 11756549. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC139742/. 
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関連文献

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