利用者:Inukawa/哺乳類の分類/論文

哺乳類の分類文献 note

★個人サイトながら、最新の研究を最速でレヴューしてくれる、たいへんありがたいサイト，の1ページ。

★全生物種の系統樹を作ってしまおうという、心躍るプロジェクト。意外にデータがちょっと古かったりするような気がする。ただし、網羅的である点はありがたい。

★すごい！　が、惜しいかな、スペリングミスがちょこちょこ目につく。

Jan Ole Kriegs, Gennady Churakov, Jerzy Jurka, Jürgen Brosius, and Jürgen Schmitz (2007) Evolutionary history of 7SL RNA-derived SINEs in Supraprimates. Trends in Genetics 23 (4): 158-161 [1] (PDF版[2])
★2007年。「真主獣大目」Euarchonta の項の参考文献。図版を見た限りでは、ツパイ目・ヒヨケザル目・サル目の分岐の前後関係は、まだ不確かということのようだ。

Gross, L. Resolving the family tree of placental mammals. PLoS Biol. 4, 0467-0468 (2006).
★2006年。「きまぐれ生物学」の、「レトロポゾンが書き込んだ哺乳類の歴史」（2006.05.23）の項の参考文献。Kriegs et al. についての，短めの一般向けレヴュー。こことここで読める。

Nishihara, H., Hasegawa, M. & Okada, N. Pegasoferae, an unexpected mammalian clade revealed by tracking ancient retroposon insertions. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 9929-9934 (2006).
★2006年。「きまぐれ生物学」の「絞り込まれたペガサスの系統」（2006.06.30）で紹介されている。東工大研究グループ，SINE法。ローラシア獣類の系統関係を確定、「ペガソフェラエ仮説」。
「ゲノム情報の蓄積や熱心な系統解析の結果、哺乳類の目レベルの系統関係についてはもはや大きな謎はほとんど残っていません」
とのこと。ここやここで読めるが、ここから飛ぶとよい。アブストラクトだけならこことこことここ。参照、「生物の多様性プロジェクト」。
ちなみに，東工大大学院岡田研究室，東工大岡田・渡邉研究室＞新聞掲載記事＞ SINE法に基づく鯨偶蹄類の系統関係・歯クジラ類の系統解析。

Kriegs, Jan Ole, Gennady Churakov, Martin Kiefmann, Ursula Jordan, Juergen Brosius, Juergen Schmitz (2006). “Retroposed Elements as Archives for the Evolutionary History of Placental Mammals”. PLoS Biol 4 (4): e91. doi:10.1371/journal.pbio.0040091. (PDF版)
★2006年。「きまぐれ生物学」の、「レトロポゾンが書き込んだ哺乳類の歴史」（2006.05.23）の項で紹介されている。レトロポゾンの挿入の有無の調査による，有胎盤類全体の系統研究。また，「真主齧上目」Euarchontoglires の項の参考文献。しかしなぜか，Wikipedia「真主齧上目」や「真主獣大目」の項に記載の系統樹は、本論文のそれとは異なる。

van Rheede, T. et al. The platypus is in its place: Nuclear genes and indels confirm the sister group relation of monotremes and therians. Mol. Biol. Evol. 23, 587-597 (2006).
★2006年。「きまぐれ生物学」の、「カモノハシこそ哺乳類の根本」（2006.05.16）の項で紹介されている。「核ゲノムにコードされた複数遺伝子の解析を行うことで、カモノハシが確かに最初に分岐した哺乳類であるとする、説得力のある結果を出しています」（傍線いぬかわ）。

Wozencraft, W. C. (16 November 2005). in Wilson, D. E., and Reeder, D.-A. M. (eds): Mammal Species of the World: A Taxonomic and Geographic Reference. 3rd ed. Vol.1 and 2. The Johns Hopkins Univ. Press, Baltimore, 541. ISBN 0-801-88221-4.
★2005年。基本資料の第3版。金子之史『ネズミの分類学』(2006)ほかで頻出。

Springer, M. S., Stanhope, M. J., Madsen, O. & de Jong, W. W. Molecules consolidate the placental mammal tree. Trends Ecol. Evol. 19, 430-438 (2004).
★2004年。「きまぐれ生物学」の、「レトロポゾンが書き込んだ哺乳類の歴史」（2006.05.23）の項で言及されている。

William J. Murphy, Eduardo Eizirik, Mark S. Springer et al. (14 December 2001). “Resolution of the Early Placental Mammal Radiation Using Bayesian Phylogenetics”. Science 294 (5550): 2348-2351. doi:10.1126/science.1067179.
★2001年。「真主齧上目」Euarchontoglires の項の参考文献。「きまぐれ生物学」の、「レトロポゾンが書き込んだ哺乳類の歴史」（2006.05.23）の項でも言及されている。分子系統学による有胎盤類の大分類の初の試み。古典、と言ってよい。

Murphy W. J., E. Eizirik, W. E. Johnson, Y. P. Zhang, O. A. Ryder, S. J. O'Brien, 2001a. Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals Nature 409:614-618. [3]
★2001年。「真主獣大目」Euarchonta の項の参考文献。

Ulfur Arnason, et al. Mammalian mitogenomic relationships and the root of the eutherian tree. Proceedings of the National Academy of Science 99: 8151-8156. [4]
★1999年。「真主獣大目」Euarchonta の項の参考文献。

McKenna, M. C. & Bell, S. K., (eds.) 1997: Classification of mammals – above the species level. –Columbia University Press, New York, 1997, xii-631
★1997年。言わずと知れた，哺乳類分類学の大著。従来の分類を大胆に刷新した……が，その出版の数年後には，分子系統学の大ラッシュが始まり，本書に記載された内容も，次々と塗り替えられていくことになる。