TFIID

TFIID（transcription factor II D）は、RNAポリメラーゼIIの転写開始前複合体を構成する基本転写因子の1つである。RNAポリメラーゼIIホロ酵素（英語版）は、真核生物のRNAポリメラーゼIIが生細胞内のタンパク質コーディング遺伝子のプロモーターへリクルートされる形態であり、RNAポリメラーゼ、一部の基本転写因子、SRBタンパク質と呼ばれる調節タンパク質から構成される。転写の開始前には、TFIID複合体は遺伝子のコアプロモーターのTATAボックスに結合する

構造

TFIIDはTATA結合タンパク質（TBP）と、TBP関連因子（英語版）（TBP-associated factors、TAF）と呼ばれるいくつかのサブユニットから構成される。試験管内では、TATAボックスを含むプロモーターの転写にはTBPのみが必要である^[1]。しかしながら、TAFはプロモーター選択性を付与し、TBPが結合するTATAボックスが存在しない場合に特に重要である^[2]。TAFはTFIID^[3]そしてB-TFIID^[4]と呼ばれる2種類の異なる複合体中に存在する。TFIID複合体はTBPと8種類以上のTAFから構成される。しかし、TBPの大部分はB-TFIID複合体中に存在し、この複合体はTBPとTAFII170（BTAF1（英語版））が1:1の比率で結合したものである^[5]。TFIIDとB-TFIIDは機能的に等価ではなく、TFIIDを用いた転写反応はSP1などの遺伝子特異的転写因子に応答するのに対し、B-TFIIDを用いて再構成された転写反応では応答しない^[5]。

TFIID複合体のサブユニットには次のようなものがある^[1]。

TBP (TATA結合タンパク質)
- または動物に存在するTBP関連因子 (TBPL1（英語版）; TBPL2（英語版）)^[6]
TAF1（英語版） (TAFII250)
TAF2（英語版） (CIF150)
TAF3（英語版） (TAFII140)
TAF4（英語版） (TAFII130/135)
TAF4B（英語版） (TAFII105)
TAF5（英語版） (TAFII100)
TAF6（英語版） (TAFII70/80)
TAF7（英語版） (TAFII55)
TAF8（英語版） (TAFII43)
TAF9（英語版） (TAFII31/32)
TAF9B（英語版） (TAFII31L)
TAF10（英語版） (TAFII30)
TAF11（英語版） (TAFII28)
TAF12（英語版） (TAFII20/15)
TAF13（英語版） (TAFII18)
TAF15（英語版） (TAFII68)

出典

^ ^a ^b Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). “Transcription of eukaryotic protein-coding genes”. Annu. Rev. Genet. 34: 77–137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
^ Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). “Structure of promoter-bound TFIID and model of human pre-initiation complex assembly”. Nature 531 (7596): 604–609. Bibcode: 2016Natur.531..604L. doi:10.1038/nature17394. PMC 4856295. PMID 27007846.
^ Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (Aug 1991). “Isolation of co-activators associated with the TATA-binding protein that mediate transcriptional activation”. Cell 66 (3): 563–576. doi:10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890.
^ “NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170 kDa (Mot1 homolog, S. cerevisiae)”. 2022年4月3日閲覧。
^ ^a ^b Timmers, H.; Meyers, RE; Sharp, PA (Sep 1992). “Composition of transcription factor B-TFIID”. Proc Natl Acad Sci USA 89 (17): 8140–4. Bibcode: 1992PNAS...89.8140T. doi:10.1073/pnas.89.17.8140. PMC 49872. PMID 1387711.
^ Duttke, SH (March 2015). “Evolution and diversification of the basal transcription machinery.”. Trends in Biochemical Sciences 40 (3): 127–9. doi:10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246.

外部リンク

Transcription Factor TFIID - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）
3D electron microscopy structures of TFIID from the EM Data Bank(EMDB)

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[Lee-1] Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). “Transcription of eukaryotic protein-coding genes”. Annu. Rev. Genet. 34: 77–137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.

[:0-2] Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). “Structure of promoter-bound TFIID and model of human pre-initiation complex assembly”. Nature 531 (7596): 604–609. Bibcode: 2016Natur.531..604L. doi:10.1038/nature17394. PMC 4856295. PMID 27007846.

[Dynlacht-3] Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (Aug 1991). “Isolation of co-activators associated with the TATA-binding protein that mediate transcriptional activation”. Cell 66 (3): 563–576. doi:10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890.

[BTAF-4] “NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170 kDa (Mot1 homolog, S. cerevisiae)”. 2022年4月3日閲覧。

[Timmers-5] Timmers, H.; Meyers, RE; Sharp, PA (Sep 1992). “Composition of transcription factor B-TFIID”. Proc Natl Acad Sci USA 89 (17): 8140–4. Bibcode: 1992PNAS...89.8140T. doi:10.1073/pnas.89.17.8140. PMC 49872. PMID 1387711.

[pmid25661246-6] Duttke, SH (March 2015). “Evolution and diversification of the basal transcription machinery.”. Trends in Biochemical Sciences 40 (3): 127–9. doi:10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246.

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構造

出典

関連項目

外部リンク